Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms