Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms