Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms