Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms