Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB2P47870 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRB2P47870 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms