Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms