Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP2P42575 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms