Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms