Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms