Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC12P31275 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC12P31275 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC12P31275 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms