Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA9P31269 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms