Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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DUSP1P28562 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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