Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms