Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms