Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALB2P22676 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms