Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNB1P20700 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms