Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CCL3L1P16619 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CCL3L1P16619 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCL3L1P16619 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CCL3L1P16619 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CCL3L1P16619 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CCL3L1P16619 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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