Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG2P13727 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRG2P13727 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRG2P13727 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms