Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL2P13500 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL2P13500 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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