Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI3P10071 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms