Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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