Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJB1P08034 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJB1P08034 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJB1P08034 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms