Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDN1P05305 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDN1P05305 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDN1P05305 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDN1P05305 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDN1P05305 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDN1P05305 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms