Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6BP04259 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms