Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PF4P02776 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PF4P02776 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PF4P02776 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PF4P02776 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PF4P02776 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PF4P02776 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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