Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALX3O95076 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ALX3O95076 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms