Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms