Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGTAO43765 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGTAO43765 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGTAO43765 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGTAO43765 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGTAO43765 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGTAO43765 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGTAO43765 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGTAO43765 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGTAO43765 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGTAO43765 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms