Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A8MVJ9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MVJ9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms