Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MBD3L5A6NJ08 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MBD3L5A6NJ08 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MBD3L5A6NJ08 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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