Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms