Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms