Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms