Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms