Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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