Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms