Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms