Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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