Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNAL1Q9UBT7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms