Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS6KB2Q9UBS0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS6KB2Q9UBS0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms