Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-18Q9QC07 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms