Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms