Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms