Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms