Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRN4Q9NRL3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRN4Q9NRL3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms