Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms