Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms