Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms