Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms