Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms